Search Results - (Author, Cooperation:M. P. Snyder)

Landscape and variation of RNA secondary structure across the human transcriptome

Y. Wan ; K. Qu ; Q. C. Zhang ; R. A. Flynn ; O. Manor ; Z. Ouyang ; J. Zhang ; R. C. Spitale ; M. P. Snyder ; E. Segal ; H. Y. Chang
Nature Publishing Group (NPG)
Published 2014

Principles of regulatory information conservation between mouse and human

Y. Cheng ; Z. Ma ; B. H. Kim ; W. Wu ; P. Cayting ; A. P. Boyle ; V. Sundaram ; X. Xing ; N. Dogan ; J. Li ; G. Euskirchen ; S. Lin ; Y. Lin ; A. Visel ; T. Kawli ; X. Yang ; D. Patacsil ; C. A. Keller ; B. Giardine ; A. Kundaje ; T. Wang ; L. A. Pennacchio ; Z. Weng ; R. C. Hardison ; M. P. Snyder
Nature Publishing Group (NPG)
Published 2014

A comparative encyclopedia of DNA elements in the mouse genome

F. Yue ; Y. Cheng ; A. Breschi ; J. Vierstra ; W. Wu ; T. Ryba ; R. Sandstrom ; Z. Ma ; C. Davis ; B. D. Pope ; Y. Shen ; D. D. Pervouchine ; S. Djebali ; R. E. Thurman ; R. Kaul ; E. Rynes ; A. Kirilusha ; G. K. Marinov ; B. A. Williams ; D. Trout ; H. Amrhein ; K. Fisher-Aylor ; I. Antoshechkin ; G. DeSalvo ; L. H. See ; M. Fastuca ; J. Drenkow ; C. Zaleski ; A. Dobin ; P. Prieto ; J. Lagarde ; G. Bussotti ; A. Tanzer ; O. Denas ; K. Li ; M. A. Bender ; M. Zhang ; R. Byron ; M. T. Groudine ; D. McCleary ; L. Pham ; Z. Ye ; S. Kuan ; L. Edsall ; Y. C. Wu ; M. D. Rasmussen ; M. S. Bansal ; M. Kellis ; C. A. Keller ; C. S. Morrissey ; T. Mishra ; D. Jain ; N. Dogan ; R. S. Harris ; P. Cayting ; T. Kawli ; A. P. Boyle ; G. Euskirchen ; A. Kundaje ; S. Lin ; Y. Lin ; C. Jansen ; V. S. Malladi ; M. S. Cline ; D. T. Erickson ; V. M. Kirkup ; K. Learned ; C. A. Sloan ; K. R. Rosenbloom ; B. Lacerda de Sousa ; K. Beal ; M. Pignatelli ; P. Flicek ; J. Lian ; T. Kahveci ; D. Lee ; W. J. Kent ; M. Ramalho Santos ; J. Herrero ; C. Notredame ; A. Johnson ; S. Vong ; K. Lee ; D. Bates ; F. Neri ; M. Diegel ; T. Canfield ; P. J. Sabo ; M. S. Wilken ; T. A. Reh ; E. Giste ; A. Shafer ; T. Kutyavin ; E. Haugen ; D. Dunn ; A. P. Reynolds ; S. Neph ; R. Humbert ; R. S. Hansen ; M. De Bruijn ; L. Selleri ; A. Rudensky ; S. Josefowicz ; R. Samstein ; E. E. Eichler ; S. H. Orkin ; D. Levasseur ; T. Papayannopoulou ; K. H. Chang ; A. Skoultchi ; S. Gosh ; C. Disteche ; P. Treuting ; Y. Wang ; M. J. Weiss ; G. A. Blobel ; X. Cao ; S. Zhong ; T. Wang ; P. J. Good ; R. F. Lowdon ; L. B. Adams ; X. Q. Zhou ; M. J. Pazin ; E. A. Feingold ; B. Wold ; J. Taylor ; A. Mortazavi ; S. M. Weissman ; J. A. Stamatoyannopoulos ; M. P. Snyder ; R. Guigo ; T. R. Gingeras ; D. M. Gilbert ; R. C. Hardison ; M. A. Beer ; B. Ren
Nature Publishing Group (NPG)
Published 2014

Single-cell chromatin accessibility reveals principles of regulatory variation

J. D. Buenrostro ; B. Wu ; U. M. Litzenburger ; D. Ruff ; M. L. Gonzales ; M. P. Snyder ; H. Y. Chang ; W. J. Greenleaf
Nature Publishing Group (NPG)
Published 2015

Topologically associating domains are stable units of replication-timing regulation

B. D. Pope ; T. Ryba ; V. Dileep ; F. Yue ; W. Wu ; O. Denas ; D. L. Vera ; Y. Wang ; R. S. Hansen ; T. K. Canfield ; R. E. Thurman ; Y. Cheng ; G. Gulsoy ; J. H. Dennis ; M. P. Snyder ; J. A. Stamatoyannopoulos ; J. Taylor ; R. C. Hardison ; T. Kahveci ; B. Ren ; D. M. Gilbert
Nature Publishing Group (NPG)
Published 2014