Search Results - (Author, Cooperation:J. Rozowsky)

Comparative analysis of regulatory information and circuits across distant species

A. P. Boyle ; C. L. Araya ; C. Brdlik ; P. Cayting ; C. Cheng ; Y. Cheng ; K. Gardner ; L. W. Hillier ; J. Janette ; L. Jiang ; D. Kasper ; T. Kawli ; P. Kheradpour ; A. Kundaje ; J. J. Li ; L. Ma ; W. Niu ; E. J. Rehm ; J. Rozowsky ; M. Slattery ; R. Spokony ; R. Terrell ; D. Vafeados ; D. Wang ; P. Weisdepp ; Y. C. Wu ; D. Xie ; K. K. Yan ; E. A. Feingold ; P. J. Good ; M. J. Pazin ; H. Huang ; P. J. Bickel ; S. E. Brenner ; V. Reinke ; R. H. Waterston ; M. Gerstein ; K. P. White ; M. Kellis ; M. Snyder
Nature Publishing Group (NPG)
Published 2014

Comparative analysis of the transcriptome across distant species

M. B. Gerstein ; J. Rozowsky ; K. K. Yan ; D. Wang ; C. Cheng ; J. B. Brown ; C. A. Davis ; L. Hillier ; C. Sisu ; J. J. Li ; B. Pei ; A. O. Harmanci ; M. O. Duff ; S. Djebali ; R. P. Alexander ; B. H. Alver ; R. Auerbach ; K. Bell ; P. J. Bickel ; M. E. Boeck ; N. P. Boley ; B. W. Booth ; L. Cherbas ; P. Cherbas ; C. Di ; A. Dobin ; J. Drenkow ; B. Ewing ; G. Fang ; M. Fastuca ; E. A. Feingold ; A. Frankish ; G. Gao ; P. J. Good ; R. Guigo ; A. Hammonds ; J. Harrow ; R. A. Hoskins ; C. Howald ; L. Hu ; H. Huang ; T. J. Hubbard ; C. Huynh ; S. Jha ; D. Kasper ; M. Kato ; T. C. Kaufman ; R. R. Kitchen ; E. Ladewig ; J. Lagarde ; E. Lai ; J. Leng ; Z. Lu ; M. MacCoss ; G. May ; R. McWhirter ; G. Merrihew ; D. M. Miller ; A. Mortazavi ; R. Murad ; B. Oliver ; S. Olson ; P. J. Park ; M. J. Pazin ; N. Perrimon ; D. Pervouchine ; V. Reinke ; A. Reymond ; G. Robinson ; A. Samsonova ; G. I. Saunders ; F. Schlesinger ; A. Sethi ; F. J. Slack ; W. C. Spencer ; M. H. Stoiber ; P. Strasbourger ; A. Tanzer ; O. A. Thompson ; K. H. Wan ; G. Wang ; H. Wang ; K. L. Watkins ; J. Wen ; K. Wen ; C. Xue ; L. Yang ; K. Yip ; C. Zaleski ; Y. Zhang ; H. Zheng ; S. E. Brenner ; B. R. Graveley ; S. E. Celniker ; T. R. Gingeras ; R. Waterston
Nature Publishing Group (NPG)
Published 2014

Architecture of the human regulatory network derived from ENCODE data

M. B. Gerstein ; A. Kundaje ; M. Hariharan ; S. G. Landt ; K. K. Yan ; C. Cheng ; X. J. Mu ; E. Khurana ; J. Rozowsky ; R. Alexander ; R. Min ; P. Alves ; A. Abyzov ; N. Addleman ; N. Bhardwaj ; A. P. Boyle ; P. Cayting ; A. Charos ; D. Z. Chen ; Y. Cheng ; D. Clarke ; C. Eastman ; G. Euskirchen ; S. Frietze ; Y. Fu ; J. Gertz ; F. Grubert ; A. Harmanci ; P. Jain ; M. Kasowski ; P. Lacroute ; J. Leng ; J. Lian ; H. Monahan ; H. O'Geen ; Z. Ouyang ; E. C. Partridge ; D. Patacsil ; F. Pauli ; D. Raha ; L. Ramirez ; T. E. Reddy ; B. Reed ; M. Shi ; T. Slifer ; J. Wang ; L. Wu ; X. Yang ; K. Y. Yip ; G. Zilberman-Schapira ; S. Batzoglou ; A. Sidow ; P. J. Farnham ; R. M. Myers ; S. M. Weissman ; M. Snyder
Nature Publishing Group (NPG)
Published 2012

Landscape of transcription in human cells

S. Djebali ; C. A. Davis ; A. Merkel ; A. Dobin ; T. Lassmann ; A. Mortazavi ; A. Tanzer ; J. Lagarde ; W. Lin ; F. Schlesinger ; C. Xue ; G. K. Marinov ; J. Khatun ; B. A. Williams ; C. Zaleski ; J. Rozowsky ; M. Roder ; F. Kokocinski ; R. F. Abdelhamid ; T. Alioto ; I. Antoshechkin ; M. T. Baer ; N. S. Bar ; P. Batut ; K. Bell ; I. Bell ; S. Chakrabortty ; X. Chen ; J. Chrast ; J. Curado ; T. Derrien ; J. Drenkow ; E. Dumais ; J. Dumais ; R. Duttagupta ; E. Falconnet ; M. Fastuca ; K. Fejes-Toth ; P. Ferreira ; S. Foissac ; M. J. Fullwood ; H. Gao ; D. Gonzalez ; A. Gordon ; H. Gunawardena ; C. Howald ; S. Jha ; R. Johnson ; P. Kapranov ; B. King ; C. Kingswood ; O. J. Luo ; E. Park ; K. Persaud ; J. B. Preall ; P. Ribeca ; B. Risk ; D. Robyr ; M. Sammeth ; L. Schaffer ; L. H. See ; A. Shahab ; J. Skancke ; A. M. Suzuki ; H. Takahashi ; H. Tilgner ; D. Trout ; N. Walters ; H. Wang ; J. Wrobel ; Y. Yu ; X. Ruan ; Y. Hayashizaki ; J. Harrow ; M. Gerstein ; T. Hubbard ; A. Reymond ; S. E. Antonarakis ; G. Hannon ; M. C. Giddings ; Y. Ruan ; B. Wold ; P. Carninci ; R. Guigo ; T. R. Gingeras
Nature Publishing Group (NPG)
Published 2012

Allele-specific epigenome maps reveal sequence-dependent stochastic switching at regulatory loci

Onuchic, V., Lurie, E., Carrero, I., Pawliczek, P., Patel, R. Y., Rozowsky, J., Galeev, T., Huang, Z., Altshuler, R. C., Zhang, Z., Harris, R. A., Coarfa, C., Ashmore, L., Bertol, J. W., Fakhouri, W. D., Yu, F., Kellis, M., Gerstein, M., Milosavljevic, A.
American Association for the Advancement of Science (AAAS)
Published 2018

Hyperacute Monocyte Gene Response Patterns Are Associated With Lower Extremity Vein Bypass Graft Failure [Original Articles]

Rehfuss, J. P., De; Sart, K. M., Rozowsky, J. M., OMalley, K. A., Moldawer, L. L., Baker, H. V., Wang, Y., Wu, R., Nelson, P. R., Berceli, S. A.
American Heart Association (AHA)
Published 2018