Search Results - (Author, Cooperation:E. T. Dermitzakis)

Putative cis-regulatory drivers in colorectal cancer

H. Ongen ; C. L. Andersen ; J. B. Bramsen ; B. Oster ; M. H. Rasmussen ; P. G. Ferreira ; J. Sandoval ; E. Vidal ; N. Whiffin ; A. Planchon ; I. Padioleau ; D. Bielser ; L. Romano ; I. Tomlinson ; R. S. Houlston ; M. Esteller ; T. F. Orntoft ; E. T. Dermitzakis
Nature Publishing Group (NPG)
Published 2014

Genome-sequencing anniversary. Genome literacy

E. T. Dermitzakis
American Association for the Advancement of Science (AAAS)
Published 2011

Integrative annotation of variants from 1092 humans: application to cancer genomics

E. Khurana ; Y. Fu ; V. Colonna ; X. J. Mu ; H. M. Kang ; T. Lappalainen ; A. Sboner ; L. Lochovsky ; J. Chen ; A. Harmanci ; J. Das ; A. Abyzov ; S. Balasubramanian ; K. Beal ; D. Chakravarty ; D. Challis ; Y. Chen ; D. Clarke ; L. Clarke ; F. Cunningham ; U. S. Evani ; P. Flicek ; R. Fragoza ; E. Garrison ; R. Gibbs ; Z. H. Gumus ; J. Herrero ; N. Kitabayashi ; Y. Kong ; K. Lage ; V. Liluashvili ; S. M. Lipkin ; D. G. MacArthur ; G. Marth ; D. Muzny ; T. H. Pers ; G. R. Ritchie ; J. A. Rosenfeld ; C. Sisu ; X. Wei ; M. Wilson ; Y. Xue ; F. Yu ; E. T. Dermitzakis ; H. Yu ; M. A. Rubin ; C. Tyler-Smith ; M. Gerstein
American Association for the Advancement of Science (AAAS)
Published 2013

Human genomics. The human transcriptome across tissues and individuals

M. Mele ; P. G. Ferreira ; F. Reverter ; D. S. DeLuca ; J. Monlong ; M. Sammeth ; T. R. Young ; J. M. Goldmann ; D. D. Pervouchine ; T. J. Sullivan ; R. Johnson ; A. V. Segre ; S. Djebali ; A. Niarchou ; F. A. Wright ; T. Lappalainen ; M. Calvo ; G. Getz ; E. T. Dermitzakis ; K. G. Ardlie ; R. Guigo
American Association for the Advancement of Science (AAAS)
Published 2015

Coordinated effects of sequence variation on DNA binding, chromatin structure, and transcription

H. Kilpinen ; S. M. Waszak ; A. R. Gschwind ; S. K. Raghav ; R. M. Witwicki ; A. Orioli ; E. Migliavacca ; M. Wiederkehr ; M. Gutierrez-Arcelus ; N. I. Panousis ; A. Yurovsky ; T. Lappalainen ; L. Romano-Palumbo ; A. Planchon ; D. Bielser ; J. Bryois ; I. Padioleau ; G. Udin ; S. Thurnheer ; D. Hacker ; L. J. Core ; J. T. Lis ; N. Hernandez ; A. Reymond ; B. Deplancke ; E. T. Dermitzakis
American Association for the Advancement of Science (AAAS)
Published 2013

Human genomics. Effect of predicted protein-truncating genetic variants on the human transcriptome

M. A. Rivas ; M. Pirinen ; D. F. Conrad ; M. Lek ; E. K. Tsang ; K. J. Karczewski ; J. B. Maller ; K. R. Kukurba ; D. S. DeLuca ; M. Fromer ; P. G. Ferreira ; K. S. Smith ; R. Zhang ; F. Zhao ; E. Banks ; R. Poplin ; D. M. Ruderfer ; S. M. Purcell ; T. Tukiainen ; E. V. Minikel ; P. D. Stenson ; D. N. Cooper ; K. H. Huang ; T. J. Sullivan ; J. Nedzel ; C. D. Bustamante ; J. B. Li ; M. J. Daly ; R. Guigo ; P. Donnelly ; K. Ardlie ; M. Sammeth ; E. T. Dermitzakis ; M. I. McCarthy ; S. B. Montgomery ; T. Lappalainen ; D. G. MacArthur
American Association for the Advancement of Science (AAAS)
Published 2015

A systematic survey of loss-of-function variants in human protein-coding genes

D. G. MacArthur ; S. Balasubramanian ; A. Frankish ; N. Huang ; J. Morris ; K. Walter ; L. Jostins ; L. Habegger ; J. K. Pickrell ; S. B. Montgomery ; C. A. Albers ; Z. D. Zhang ; D. F. Conrad ; G. Lunter ; H. Zheng ; Q. Ayub ; M. A. DePristo ; E. Banks ; M. Hu ; R. E. Handsaker ; J. A. Rosenfeld ; M. Fromer ; M. Jin ; X. J. Mu ; E. Khurana ; K. Ye ; M. Kay ; G. I. Saunders ; M. M. Suner ; T. Hunt ; I. H. Barnes ; C. Amid ; D. R. Carvalho-Silva ; A. H. Bignell ; C. Snow ; B. Yngvadottir ; S. Bumpstead ; D. N. Cooper ; Y. Xue ; I. G. Romero ; J. Wang ; Y. Li ; R. A. Gibbs ; S. A. McCarroll ; E. T. Dermitzakis ; J. K. Pritchard ; J. C. Barrett ; J. Harrow ; M. E. Hurles ; M. B. Gerstein ; C. Tyler-Smith
American Association for the Advancement of Science (AAAS)
Published 2012

Insights into hominid evolution from the gorilla genome sequence

A. Scally ; J. Y. Dutheil ; L. W. Hillier ; G. E. Jordan ; I. Goodhead ; J. Herrero ; A. Hobolth ; T. Lappalainen ; T. Mailund ; T. Marques-Bonet ; S. McCarthy ; S. H. Montgomery ; P. C. Schwalie ; Y. A. Tang ; M. C. Ward ; Y. Xue ; B. Yngvadottir ; C. Alkan ; L. N. Andersen ; Q. Ayub ; E. V. Ball ; K. Beal ; B. J. Bradley ; Y. Chen ; C. M. Clee ; S. Fitzgerald ; T. A. Graves ; Y. Gu ; P. Heath ; A. Heger ; E. Karakoc ; A. Kolb-Kokocinski ; G. K. Laird ; G. Lunter ; S. Meader ; M. Mort ; J. C. Mullikin ; K. Munch ; T. D. O'Connor ; A. D. Phillips ; J. Prado-Martinez ; A. S. Rogers ; S. Sajjadian ; D. Schmidt ; K. Shaw ; J. T. Simpson ; P. D. Stenson ; D. J. Turner ; L. Vigilant ; A. J. Vilella ; W. Whitener ; B. Zhu ; D. N. Cooper ; P. de Jong ; E. T. Dermitzakis ; E. E. Eichler ; P. Flicek ; N. Goldman ; N. I. Mundy ; Z. Ning ; D. T. Odom ; C. P. Ponting ; M. A. Quail ; O. A. Ryder ; S. M. Searle ; W. C. Warren ; R. K. Wilson ; M. H. Schierup ; J. Rogers ; C. Tyler-Smith ; R. Durbin
Nature Publishing Group (NPG)
Published 2012

Transcriptome and genome sequencing uncovers functional variation in humans

T. Lappalainen ; M. Sammeth ; M. R. Friedlander ; P. A. t Hoen ; J. Monlong ; M. A. Rivas ; M. Gonzalez-Porta ; N. Kurbatova ; T. Griebel ; P. G. Ferreira ; M. Barann ; T. Wieland ; L. Greger ; M. van Iterson ; J. Almlof ; P. Ribeca ; I. Pulyakhina ; D. Esser ; T. Giger ; A. Tikhonov ; M. Sultan ; G. Bertier ; D. G. MacArthur ; M. Lek ; E. Lizano ; H. P. Buermans ; I. Padioleau ; T. Schwarzmayr ; O. Karlberg ; H. Ongen ; H. Kilpinen ; S. Beltran ; M. Gut ; K. Kahlem ; V. Amstislavskiy ; O. Stegle ; M. Pirinen ; S. B. Montgomery ; P. Donnelly ; M. I. McCarthy ; P. Flicek ; T. M. Strom ; H. Lehrach ; S. Schreiber ; R. Sudbrak ; A. Carracedo ; S. E. Antonarakis ; R. Hasler ; A. C. Syvanen ; G. J. van Ommen ; A. Brazma ; T. Meitinger ; P. Rosenstiel ; R. Guigo ; I. G. Gut ; X. Estivill ; E. T. Dermitzakis
Nature Publishing Group (NPG)
Published 2013