Search Results - (Author, Cooperation:D. T. Jones)

Divergent clonal selection dominates medulloblastoma at recurrence

A. S. Morrissy ; L. Garzia ; D. J. Shih ; S. Zuyderduyn ; X. Huang ; P. Skowron ; M. Remke ; F. M. Cavalli ; V. Ramaswamy ; P. E. Lindsay ; S. Jelveh ; L. K. Donovan ; X. Wang ; B. Luu ; K. Zayne ; Y. Li ; C. Mayoh ; N. Thiessen ; E. Mercier ; K. L. Mungall ; Y. Ma ; K. Tse ; T. Zeng ; K. Shumansky ; A. J. Roth ; S. Shah ; H. Farooq ; N. Kijima ; B. L. Holgado ; J. J. Lee ; S. Matan-Lithwick ; J. Liu ; S. C. Mack ; A. Manno ; K. A. Michealraj ; C. Nor ; J. Peacock ; L. Qin ; J. Reimand ; A. Rolider ; Y. Y. Thompson ; X. Wu ; T. Pugh ; A. Ally ; M. Bilenky ; Y. S. Butterfield ; R. Carlsen ; Y. Cheng ; E. Chuah ; R. D. Corbett ; N. Dhalla ; A. He ; D. Lee ; H. I. Li ; W. Long ; M. Mayo ; P. Plettner ; J. Q. Qian ; J. E. Schein ; A. Tam ; T. Wong ; I. Birol ; Y. Zhao ; C. C. Faria ; J. Pimentel ; S. Nunes ; T. Shalaby ; M. Grotzer ; I. F. Pollack ; R. L. Hamilton ; X. N. Li ; A. E. Bendel ; D. W. Fults ; A. W. Walter ; T. Kumabe ; T. Tominaga ; V. P. Collins ; Y. J. Cho ; C. Hoffman ; D. Lyden ; J. H. Wisoff ; J. H. Garvin, Jr. ; D. S. Stearns ; L. Massimi ; U. Schuller ; J. Sterba ; K. Zitterbart ; S. Puget ; O. Ayrault ; S. E. Dunn ; D. P. Tirapelli ; C. G. Carlotti ; H. Wheeler ; A. R. Hallahan ; W. Ingram ; T. J. MacDonald ; J. J. Olson ; E. G. Van Meir ; J. Y. Lee ; K. C. Wang ; S. K. Kim ; B. K. Cho ; T. Pietsch ; G. Fleischhack ; S. Tippelt ; Y. S. Ra ; S. Bailey ; J. C. Lindsey ; S. C. Clifford ; C. G. Eberhart ; M. K. Cooper ; R. J. Packer ; M. Massimino ; M. L. Garre ; U. Bartels ; U. Tabori ; C. E. Hawkins ; P. Dirks ; E. Bouffet ; J. T. Rutka ; R. J. Wechsler-Reya ; W. A. Weiss ; L. S. Collier ; A. J. Dupuy ; A. Korshunov ; D. T. Jones ; M. Kool ; P. A. Northcott ; S. M. Pfister ; D. A. Largaespada ; A. J. Mungall ; R. A. Moore ; N. Jabado ; G. D. Bader ; S. J. Jones ; D. Malkin ; M. A. Marra ; M. D. Taylor
Nature Publishing Group (NPG)
Published 2016

Subgroup-specific structural variation across 1,000 medulloblastoma genomes

P. A. Northcott ; D. J. Shih ; J. Peacock ; L. Garzia ; A. S. Morrissy ; T. Zichner ; A. M. Stutz ; A. Korshunov ; J. Reimand ; S. E. Schumacher ; R. Beroukhim ; D. W. Ellison ; C. R. Marshall ; A. C. Lionel ; S. Mack ; A. Dubuc ; Y. Yao ; V. Ramaswamy ; B. Luu ; A. Rolider ; F. M. Cavalli ; X. Wang ; M. Remke ; X. Wu ; R. Y. Chiu ; A. Chu ; E. Chuah ; R. D. Corbett ; G. R. Hoad ; S. D. Jackman ; Y. Li ; A. Lo ; K. L. Mungall ; K. M. Nip ; J. Q. Qian ; A. G. Raymond ; N. T. Thiessen ; R. J. Varhol ; I. Birol ; R. A. Moore ; A. J. Mungall ; R. Holt ; D. Kawauchi ; M. F. Roussel ; M. Kool ; D. T. Jones ; H. Witt ; L. A. Fernandez ; A. M. Kenney ; R. J. Wechsler-Reya ; P. Dirks ; T. Aviv ; W. A. Grajkowska ; M. Perek-Polnik ; C. C. Haberler ; O. Delattre ; S. S. Reynaud ; F. F. Doz ; S. S. Pernet-Fattet ; B. K. Cho ; S. K. Kim ; K. C. Wang ; W. Scheurlen ; C. G. Eberhart ; M. Fevre-Montange ; A. Jouvet ; I. F. Pollack ; X. Fan ; K. M. Muraszko ; G. Y. Gillespie ; C. Di Rocco ; L. Massimi ; E. M. Michiels ; N. K. Kloosterhof ; P. J. French ; J. M. Kros ; J. M. Olson ; R. G. Ellenbogen ; K. Zitterbart ; L. Kren ; R. C. Thompson ; M. K. Cooper ; B. Lach ; R. E. McLendon ; D. D. Bigner ; A. Fontebasso ; S. Albrecht ; N. Jabado ; J. C. Lindsey ; S. Bailey ; N. Gupta ; W. A. Weiss ; L. Bognar ; A. Klekner ; T. E. Van Meter ; T. Kumabe ; T. Tominaga ; S. K. Elbabaa ; J. R. Leonard ; J. B. Rubin ; L. M. Liau ; E. G. Van Meir ; M. Fouladi ; H. Nakamura ; G. Cinalli ; M. Garami ; P. Hauser ; A. G. Saad ; A. Iolascon ; S. Jung ; C. G. Carlotti ; R. Vibhakar ; Y. S. Ra ; S. Robinson ; M. Zollo ; C. C. Faria ; J. A. Chan ; M. L. Levy ; P. H. Sorensen ; M. Meyerson ; S. L. Pomeroy ; Y. J. Cho ; G. D. Bader ; U. Tabori ; C. E. Hawkins ; E. Bouffet ; S. W. Scherer ; J. T. Rutka ; D. Malkin ; S. C. Clifford ; S. J. Jones ; J. O. Korbel ; S. M. Pfister ; M. A. Marra ; M. D. Taylor
Nature Publishing Group (NPG)
Published 2012

Enhancer hijacking activates GFI1 family oncogenes in medulloblastoma

P. A. Northcott ; C. Lee ; T. Zichner ; A. M. Stutz ; S. Erkek ; D. Kawauchi ; D. J. Shih ; V. Hovestadt ; M. Zapatka ; D. Sturm ; D. T. Jones ; M. Kool ; M. Remke ; F. M. Cavalli ; S. Zuyderduyn ; G. D. Bader ; S. VandenBerg ; L. A. Esparza ; M. Ryzhova ; W. Wang ; A. Wittmann ; S. Stark ; L. Sieber ; H. Seker-Cin ; L. Linke ; F. Kratochwil ; N. Jager ; I. Buchhalter ; C. D. Imbusch ; G. Zipprich ; B. Raeder ; S. Schmidt ; N. Diessl ; S. Wolf ; S. Wiemann ; B. Brors ; C. Lawerenz ; J. Eils ; H. J. Warnatz ; T. Risch ; M. L. Yaspo ; U. D. Weber ; C. C. Bartholomae ; C. von Kalle ; E. Turanyi ; P. Hauser ; E. Sanden ; A. Darabi ; P. Siesjo ; J. Sterba ; K. Zitterbart ; D. Sumerauer ; P. van Sluis ; R. Versteeg ; R. Volckmann ; J. Koster ; M. U. Schuhmann ; M. Ebinger ; H. L. Grimes ; G. W. Robinson ; A. Gajjar ; M. Mynarek ; K. von Hoff ; S. Rutkowski ; T. Pietsch ; W. Scheurlen ; J. Felsberg ; G. Reifenberger ; A. E. Kulozik ; A. von Deimling ; O. Witt ; R. Eils ; R. J. Gilbertson ; A. Korshunov ; M. D. Taylor ; P. Lichter ; J. O. Korbel ; R. J. Wechsler-Reya ; S. M. Pfister
Nature Publishing Group (NPG)
Published 2014

Epigenomic alterations define lethal CIMP-positive ependymomas of infancy

S. C. Mack ; H. Witt ; R. M. Piro ; L. Gu ; S. Zuyderduyn ; A. M. Stutz ; X. Wang ; M. Gallo ; L. Garzia ; K. Zayne ; X. Zhang ; V. Ramaswamy ; N. Jager ; D. T. Jones ; M. Sill ; T. J. Pugh ; M. Ryzhova ; K. M. Wani ; D. J. Shih ; R. Head ; M. Remke ; S. D. Bailey ; T. Zichner ; C. C. Faria ; M. Barszczyk ; S. Stark ; H. Seker-Cin ; S. Hutter ; P. Johann ; S. Bender ; V. Hovestadt ; T. Tzaridis ; A. M. Dubuc ; P. A. Northcott ; J. Peacock ; K. C. Bertrand ; S. Agnihotri ; F. M. Cavalli ; I. Clarke ; K. Nethery-Brokx ; C. L. Creasy ; S. K. Verma ; J. Koster ; X. Wu ; Y. Yao ; T. Milde ; P. Sin-Chan ; J. Zuccaro ; L. Lau ; S. Pereira ; P. Castelo-Branco ; M. Hirst ; M. A. Marra ; S. S. Roberts ; D. Fults ; L. Massimi ; Y. J. Cho ; T. Van Meter ; W. Grajkowska ; B. Lach ; A. E. Kulozik ; A. von Deimling ; O. Witt ; S. W. Scherer ; X. Fan ; K. M. Muraszko ; M. Kool ; S. L. Pomeroy ; N. Gupta ; J. Phillips ; A. Huang ; U. Tabori ; C. Hawkins ; D. Malkin ; P. N. Kongkham ; W. A. Weiss ; N. Jabado ; J. T. Rutka ; E. Bouffet ; J. O. Korbel ; M. Lupien ; K. D. Aldape ; G. D. Bader ; R. Eils ; P. Lichter ; P. B. Dirks ; S. M. Pfister ; A. Korshunov ; M. D. Taylor
Nature Publishing Group (NPG)
Published 2014

Active medulloblastoma enhancers reveal subgroup-specific cellular origins

C. Y. Lin ; S. Erkek ; Y. Tong ; L. Yin ; A. J. Federation ; M. Zapatka ; P. Haldipur ; D. Kawauchi ; T. Risch ; H. J. Warnatz ; B. C. Worst ; B. Ju ; B. A. Orr ; R. Zeid ; D. R. Polaski ; M. Segura-Wang ; S. M. Waszak ; D. T. Jones ; M. Kool ; V. Hovestadt ; I. Buchhalter ; L. Sieber ; P. Johann ; L. Chavez ; S. Groschel ; M. Ryzhova ; A. Korshunov ; W. Chen ; V. V. Chizhikov ; K. J. Millen ; V. Amstislavskiy ; H. Lehrach ; M. L. Yaspo ; R. Eils ; P. Lichter ; J. O. Korbel ; S. M. Pfister ; J. E. Bradner ; P. A. Northcott
Nature Publishing Group (NPG)
Published 2016

Signatures of mutational processes in human cancer

L. B. Alexandrov ; S. Nik-Zainal ; D. C. Wedge ; S. A. Aparicio ; S. Behjati ; A. V. Biankin ; G. R. Bignell ; N. Bolli ; A. Borg ; A. L. Borresen-Dale ; S. Boyault ; B. Burkhardt ; A. P. Butler ; C. Caldas ; H. R. Davies ; C. Desmedt ; R. Eils ; J. E. Eyfjord ; J. A. Foekens ; M. Greaves ; F. Hosoda ; B. Hutter ; T. Ilicic ; S. Imbeaud ; M. Imielinski ; N. Jager ; D. T. Jones ; D. Jones ; S. Knappskog ; M. Kool ; S. R. Lakhani ; C. Lopez-Otin ; S. Martin ; N. C. Munshi ; H. Nakamura ; P. A. Northcott ; M. Pajic ; E. Papaemmanuil ; A. Paradiso ; J. V. Pearson ; X. S. Puente ; K. Raine ; M. Ramakrishna ; A. L. Richardson ; J. Richter ; P. Rosenstiel ; M. Schlesner ; T. N. Schumacher ; P. N. Span ; J. W. Teague ; Y. Totoki ; A. N. Tutt ; R. Valdes-Mas ; M. M. van Buuren ; L. van 't Veer ; A. Vincent-Salomon ; N. Waddell ; L. R. Yates ; J. Zucman-Rossi ; P. A. Futreal ; U. McDermott ; P. Lichter ; M. Meyerson ; S. M. Grimmond ; R. Siebert ; E. Campo ; T. Shibata ; S. M. Pfister ; P. J. Campbell ; M. R. Stratton
Nature Publishing Group (NPG)
Published 2013

Decoding the regulatory landscape of medulloblastoma using DNA methylation sequencing

V. Hovestadt ; D. T. Jones ; S. Picelli ; W. Wang ; M. Kool ; P. A. Northcott ; M. Sultan ; K. Stachurski ; M. Ryzhova ; H. J. Warnatz ; M. Ralser ; S. Brun ; J. Bunt ; N. Jager ; K. Kleinheinz ; S. Erkek ; U. D. Weber ; C. C. Bartholomae ; C. von Kalle ; C. Lawerenz ; J. Eils ; J. Koster ; R. Versteeg ; T. Milde ; O. Witt ; S. Schmidt ; S. Wolf ; T. Pietsch ; S. Rutkowski ; W. Scheurlen ; M. D. Taylor ; B. Brors ; J. Felsberg ; G. Reifenberger ; A. Borkhardt ; H. Lehrach ; R. J. Wechsler-Reya ; R. Eils ; M. L. Yaspo ; P. Landgraf ; A. Korshunov ; M. Zapatka ; B. Radlwimmer ; S. M. Pfister ; P. Lichter
Nature Publishing Group (NPG)
Published 2014

Driver mutations in histone H3.3 and chromatin remodelling genes in paediatric glioblastoma

J. Schwartzentruber ; A. Korshunov ; X. Y. Liu ; D. T. Jones ; E. Pfaff ; K. Jacob ; D. Sturm ; A. M. Fontebasso ; D. A. Quang ; M. Tonjes ; V. Hovestadt ; S. Albrecht ; M. Kool ; A. Nantel ; C. Konermann ; A. Lindroth ; N. Jager ; T. Rausch ; M. Ryzhova ; J. O. Korbel ; T. Hielscher ; P. Hauser ; M. Garami ; A. Klekner ; L. Bognar ; M. Ebinger ; M. U. Schuhmann ; W. Scheurlen ; A. Pekrun ; M. C. Fruhwald ; W. Roggendorf ; C. Kramm ; M. Durken ; J. Atkinson ; P. Lepage ; A. Montpetit ; M. Zakrzewska ; K. Zakrzewski ; P. P. Liberski ; Z. Dong ; P. Siegel ; A. E. Kulozik ; M. Zapatka ; A. Guha ; D. Malkin ; J. Felsberg ; G. Reifenberger ; A. von Deimling ; K. Ichimura ; V. P. Collins ; H. Witt ; T. Milde ; O. Witt ; C. Zhang ; P. Castelo-Branco ; P. Lichter ; D. Faury ; U. Tabori ; C. Plass ; J. Majewski ; S. M. Pfister ; N. Jabado
Nature Publishing Group (NPG)
Published 2012

Medulloblastoma exome sequencing uncovers subtype-specific somatic mutations

T. J. Pugh ; S. D. Weeraratne ; T. C. Archer ; D. A. Pomeranz Krummel ; D. Auclair ; J. Bochicchio ; M. O. Carneiro ; S. L. Carter ; K. Cibulskis ; R. L. Erlich ; H. Greulich ; M. S. Lawrence ; N. J. Lennon ; A. McKenna ; J. Meldrim ; A. H. Ramos ; M. G. Ross ; C. Russ ; E. Shefler ; A. Sivachenko ; B. Sogoloff ; P. Stojanov ; P. Tamayo ; J. P. Mesirov ; V. Amani ; N. Teider ; S. Sengupta ; J. P. Francois ; P. A. Northcott ; M. D. Taylor ; F. Yu ; G. R. Crabtree ; A. G. Kautzman ; S. B. Gabriel ; G. Getz ; N. Jager ; D. T. Jones ; P. Lichter ; S. M. Pfister ; T. M. Roberts ; M. Meyerson ; S. L. Pomeroy ; Y. J. Cho
Nature Publishing Group (NPG)
Published 2012

Dissecting the genomic complexity underlying medulloblastoma

D. T. Jones ; N. Jager ; M. Kool ; T. Zichner ; B. Hutter ; M. Sultan ; Y. J. Cho ; T. J. Pugh ; V. Hovestadt ; A. M. Stutz ; T. Rausch ; H. J. Warnatz ; M. Ryzhova ; S. Bender ; D. Sturm ; S. Pleier ; H. Cin ; E. Pfaff ; L. Sieber ; A. Wittmann ; M. Remke ; H. Witt ; S. Hutter ; T. Tzaridis ; J. Weischenfeldt ; B. Raeder ; M. Avci ; V. Amstislavskiy ; M. Zapatka ; U. D. Weber ; Q. Wang ; B. Lasitschka ; C. C. Bartholomae ; M. Schmidt ; C. von Kalle ; V. Ast ; C. Lawerenz ; J. Eils ; R. Kabbe ; V. Benes ; P. van Sluis ; J. Koster ; R. Volckmann ; D. Shih ; M. J. Betts ; R. B. Russell ; S. Coco ; G. P. Tonini ; U. Schuller ; V. Hans ; N. Graf ; Y. J. Kim ; C. Monoranu ; W. Roggendorf ; A. Unterberg ; C. Herold-Mende ; T. Milde ; A. E. Kulozik ; A. von Deimling ; O. Witt ; E. Maass ; J. Rossler ; M. Ebinger ; M. U. Schuhmann ; M. C. Fruhwald ; M. Hasselblatt ; N. Jabado ; S. Rutkowski ; A. O. von Bueren ; D. Williamson ; S. C. Clifford ; M. G. McCabe ; V. P. Collins ; S. Wolf ; S. Wiemann ; H. Lehrach ; B. Brors ; W. Scheurlen ; J. Felsberg ; G. Reifenberger ; P. A. Northcott ; M. D. Taylor ; M. Meyerson ; S. L. Pomeroy ; M. L. Yaspo ; J. O. Korbel ; A. Korshunov ; R. Eils ; S. M. Pfister ; P. Lichter
Nature Publishing Group (NPG)
Published 2012

Comment on "Calcareous nannoplankton response to surface-water acidification around Oceanic Anoxic Event 1a"

S. J. Gibbs ; S. A. Robinson ; P. R. Bown ; T. D. Jones ; J. Henderiks
American Association for the Advancement of Science (AAAS)
Published 2011

Metabolism. Lysosomal amino acid transporter SLC38A9 signals arginine sufficiency to mTORC1

S. Wang ; Z. Y. Tsun ; R. L. Wolfson ; K. Shen ; G. A. Wyant ; M. E. Plovanich ; E. D. Yuan ; T. D. Jones ; L. Chantranupong ; W. Comb ; T. Wang ; L. Bar-Peled ; R. Zoncu ; C. Straub ; C. Kim ; J. Park ; B. L. Sabatini ; D. M. Sabatini
American Association for the Advancement of Science (AAAS)
Published 2015

A Novel Method for Rapid Molecular Subgrouping of Medulloblastoma

Gomez, S., Garrido-Garcia, A., Garcia-Gerique, L., Lemos, I., Sunol, M., de Torres, C., Kulis, M., Perez-Jaume, S., Carcaboso, A. M., Luu, B., Kieran, M. W., Jabado, N., Kozlenkov, A., Dracheva, S., Ramaswamy, V., Hovestadt, V., Johann, P., Jones, D. T. W., Pfister, S. M., Morales La Madrid, A., Cruz, O., Taylor, M. D., Martin-Subero, J.-I., Mora, J., Lavarino, C.
The American Association for Cancer Research (AACR)
Published 2018

PROPOSALS FOR E.A.E.G. JOURNAL (prepared by the Publications Committee of E.A.E.G.)

Germain-Jones, D. T. ; Baars, B. ; Fitch, A. A.

Oxford, UK : Blackwell Publishing Ltd
Published 1961

WHAT IS OUR CONTRIBUTION?

GERMAIN-JONES, D. T.

Oxford, UK : Blackwell Publishing Ltd
Published 1954

Electrical characterization of neutron irradiation induced defects in undoped epitaxially grown n-GaAs

Auret, F. D. ; Goodman, S. A. ; Myburg, G. ; Barnard, W. O. ; Jones, D. T. L.

[S.l.] : American Institute of Physics (AIP)
Published 1993

Studies on Clostridium acetobutylicum ginA promoters and antisense RNA

Janssen, P. J. ; Jones, D. T. ; Woods, D. R.

Oxford, UK : Blackwell Publishing Ltd
Published 1990

Zenith atmospheric attenuation measurements

GEBBIE, H. A. ; LLEWELLYN-JONES, D. T. ; KNIGHT, R. J.

[s.l.] : Nature Publishing Group
Published 1982

Absorption by water vapour at 7.1 cm −1 and its temperature dependence

JONES, D. T. LLEWELLYN ; KNIGHT, R. J. ; GEBBIE, H. A.

[s.l.] : Nature Publishing Group
Published 1978

Measurement of attenuation in low-loss optical glass

Laybourn, P. J. R. ; Gambling, W. A. ; Jones, D. T.
Springer
Published 1971