Search Results - (Author, Cooperation:D. Reich)

Global diversity, population stratification, and selection of human copy-number variation

P. H. Sudmant ; S. Mallick ; B. J. Nelson ; F. Hormozdiari ; N. Krumm ; J. Huddleston ; B. P. Coe ; C. Baker ; S. Nordenfelt ; M. Bamshad ; L. B. Jorde ; O. L. Posukh ; H. Sahakyan ; W. S. Watkins ; L. Yepiskoposyan ; M. S. Abdullah ; C. M. Bravi ; C. Capelli ; T. Hervig ; J. T. Wee ; C. Tyler-Smith ; G. van Driem ; I. G. Romero ; A. R. Jha ; S. Karachanak-Yankova ; D. Toncheva ; D. Comas ; B. Henn ; T. Kivisild ; A. Ruiz-Linares ; A. Sajantila ; E. Metspalu ; J. Parik ; R. Villems ; E. B. Starikovskaya ; G. Ayodo ; C. M. Beall ; A. Di Rienzo ; M. F. Hammer ; R. Khusainova ; E. Khusnutdinova ; W. Klitz ; C. Winkler ; D. Labuda ; M. Metspalu ; S. A. Tishkoff ; S. Dryomov ; R. Sukernik ; N. Patterson ; D. Reich ; E. E. Eichler
American Association for the Advancement of Science (AAAS)
Published 2015

Ancient DNA reveals key stages in the formation of central European mitochondrial genetic diversity

G. Brandt ; W. Haak ; C. J. Adler ; C. Roth ; A. Szecsenyi-Nagy ; S. Karimnia ; S. Moller-Rieker ; H. Meller ; R. Ganslmeier ; S. Friederich ; V. Dresely ; N. Nicklisch ; J. K. Pickrell ; F. Sirocko ; D. Reich ; A. Cooper ; K. W. Alt
American Association for the Advancement of Science (AAAS)
Published 2013

Ancient human genomes suggest three ancestral populations for present-day Europeans

I. Lazaridis ; N. Patterson ; A. Mittnik ; G. Renaud ; S. Mallick ; K. Kirsanow ; P. H. Sudmant ; J. G. Schraiber ; S. Castellano ; M. Lipson ; B. Berger ; C. Economou ; R. Bollongino ; Q. Fu ; K. I. Bos ; S. Nordenfelt ; H. Li ; C. de Filippo ; K. Prufer ; S. Sawyer ; C. Posth ; W. Haak ; F. Hallgren ; E. Fornander ; N. Rohland ; D. Delsate ; M. Francken ; J. M. Guinet ; J. Wahl ; G. Ayodo ; H. A. Babiker ; G. Bailliet ; E. Balanovska ; O. Balanovsky ; R. Barrantes ; G. Bedoya ; H. Ben-Ami ; J. Bene ; F. Berrada ; C. M. Bravi ; F. Brisighelli ; G. B. Busby ; F. Cali ; M. Churnosov ; D. E. Cole ; D. Corach ; L. Damba ; G. van Driem ; S. Dryomov ; J. M. Dugoujon ; S. A. Fedorova ; I. Gallego Romero ; M. Gubina ; M. Hammer ; B. M. Henn ; T. Hervig ; U. Hodoglugil ; A. R. Jha ; S. Karachanak-Yankova ; R. Khusainova ; E. Khusnutdinova ; R. Kittles ; T. Kivisild ; W. Klitz ; V. Kucinskas ; A. Kushniarevich ; L. Laredj ; S. Litvinov ; T. Loukidis ; R. W. Mahley ; B. Melegh ; E. Metspalu ; J. Molina ; J. Mountain ; K. Nakkalajarvi ; D. Nesheva ; T. Nyambo ; L. Osipova ; J. Parik ; F. Platonov ; O. Posukh ; V. Romano ; F. Rothhammer ; I. Rudan ; R. Ruizbakiev ; H. Sahakyan ; A. Sajantila ; A. Salas ; E. B. Starikovskaya ; A. Tarekegn ; D. Toncheva ; S. Turdikulova ; I. Uktveryte ; O. Utevska ; R. Vasquez ; M. Villena ; M. Voevoda ; C. A. Winkler ; L. Yepiskoposyan ; P. Zalloua ; T. Zemunik ; A. Cooper ; C. Capelli ; M. G. Thomas ; A. Ruiz-Linares ; S. A. Tishkoff ; L. Singh ; K. Thangaraj ; R. Villems ; D. Comas ; R. Sukernik ; M. Metspalu ; M. Meyer ; E. E. Eichler ; J. Burger ; M. Slatkin ; S. Paabo ; J. Kelso ; D. Reich ; J. Krause
Nature Publishing Group (NPG)
Published 2014

The genomic landscape of Neanderthal ancestry in present-day humans

S. Sankararaman ; S. Mallick ; M. Dannemann ; K. Prufer ; J. Kelso ; S. Paabo ; N. Patterson ; D. Reich
Nature Publishing Group (NPG)
Published 2014

Genome sequence of a 45,000-year-old modern human from western Siberia

Q. Fu ; H. Li ; P. Moorjani ; F. Jay ; S. M. Slepchenko ; A. A. Bondarev ; P. L. Johnson ; A. Aximu-Petri ; K. Prufer ; C. de Filippo ; M. Meyer ; N. Zwyns ; D. C. Salazar-Garcia ; Y. V. Kuzmin ; S. G. Keates ; P. A. Kosintsev ; D. I. Razhev ; M. P. Richards ; N. V. Peristov ; M. Lachmann ; K. Douka ; T. F. Higham ; M. Slatkin ; J. J. Hublin ; D. Reich ; J. Kelso ; T. B. Viola ; S. Paabo
Nature Publishing Group (NPG)
Published 2014

Peptide design by optimization on a data-parameterized protein interaction landscape [Biophysics and Computational Biology]

Justin M. Jenson, Vincent Xue, Lindsey Stretz, Tirtha Mandal, Lothar ȁ C;Lutherȁ D; Reich, Amy E. Keating
National Academy of Sciences
Published 2018

Reconstructing Native American population history

D. Reich ; N. Patterson ; D. Campbell ; A. Tandon ; S. Mazieres ; N. Ray ; M. V. Parra ; W. Rojas ; C. Duque ; N. Mesa ; L. F. Garcia ; O. Triana ; S. Blair ; A. Maestre ; J. C. Dib ; C. M. Bravi ; G. Bailliet ; D. Corach ; T. Hunemeier ; M. C. Bortolini ; F. M. Salzano ; M. L. Petzl-Erler ; V. Acuna-Alonzo ; C. Aguilar-Salinas ; S. Canizales-Quinteros ; T. Tusie-Luna ; L. Riba ; M. Rodriguez-Cruz ; M. Lopez-Alarcon ; R. Coral-Vazquez ; T. Canto-Cetina ; I. Silva-Zolezzi ; J. C. Fernandez-Lopez ; A. V. Contreras ; G. Jimenez-Sanchez ; M. J. Gomez-Vazquez ; J. Molina ; A. Carracedo ; A. Salas ; C. Gallo ; G. Poletti ; D. B. Witonsky ; G. Alkorta-Aranburu ; R. I. Sukernik ; L. Osipova ; S. A. Fedorova ; R. Vasquez ; M. Villena ; C. Moreau ; R. Barrantes ; D. Pauls ; L. Excoffier ; G. Bedoya ; F. Rothhammer ; J. M. Dugoujon ; G. Larrouy ; W. Klitz ; D. Labuda ; J. Kidd ; K. Kidd ; A. Di Rienzo ; N. B. Freimer ; A. L. Price ; A. Ruiz-Linares
Nature Publishing Group (NPG)
Published 2012

A high-coverage genome sequence from an archaic Denisovan individual

M. Meyer ; M. Kircher ; M. T. Gansauge ; H. Li ; F. Racimo ; S. Mallick ; J. G. Schraiber ; F. Jay ; K. Prufer ; C. de Filippo ; P. H. Sudmant ; C. Alkan ; Q. Fu ; R. Do ; N. Rohland ; A. Tandon ; M. Siebauer ; R. E. Green ; K. Bryc ; A. W. Briggs ; U. Stenzel ; J. Dabney ; J. Shendure ; J. Kitzman ; M. F. Hammer ; M. V. Shunkov ; A. P. Derevianko ; N. Patterson ; A. M. Andres ; E. E. Eichler ; M. Slatkin ; D. Reich ; J. Kelso ; S. Paabo
American Association for the Advancement of Science (AAAS)
Published 2012

Gibbon genome and the fast karyotype evolution of small apes

L. Carbone ; R. A. Harris ; S. Gnerre ; K. R. Veeramah ; B. Lorente-Galdos ; J. Huddleston ; T. J. Meyer ; J. Herrero ; C. Roos ; B. Aken ; F. Anaclerio ; N. Archidiacono ; C. Baker ; D. Barrell ; M. A. Batzer ; K. Beal ; A. Blancher ; C. L. Bohrson ; M. Brameier ; M. S. Campbell ; O. Capozzi ; C. Casola ; G. Chiatante ; A. Cree ; A. Damert ; P. J. de Jong ; L. Dumas ; M. Fernandez-Callejo ; P. Flicek ; N. V. Fuchs ; I. Gut ; M. Gut ; M. W. Hahn ; J. Hernandez-Rodriguez ; L. W. Hillier ; R. Hubley ; B. Ianc ; Z. Izsvak ; N. G. Jablonski ; L. M. Johnstone ; A. Karimpour-Fard ; M. K. Konkel ; D. Kostka ; N. H. Lazar ; S. L. Lee ; L. R. Lewis ; Y. Liu ; D. P. Locke ; S. Mallick ; F. L. Mendez ; M. Muffato ; L. V. Nazareth ; K. A. Nevonen ; M. O'Bleness ; C. Ochis ; D. T. Odom ; K. S. Pollard ; J. Quilez ; D. Reich ; M. Rocchi ; G. G. Schumann ; S. Searle ; J. M. Sikela ; G. Skollar ; A. Smit ; K. Sonmez ; B. ten Hallers ; E. Terhune ; G. W. Thomas ; B. Ullmer ; M. Ventura ; J. A. Walker ; J. D. Wall ; L. Walter ; M. C. Ward ; S. J. Wheelan ; C. W. Whelan ; S. White ; L. J. Wilhelm ; A. E. Woerner ; M. Yandell ; B. Zhu ; M. F. Hammer ; T. Marques-Bonet ; E. E. Eichler ; L. Fulton ; C. Fronick ; D. M. Muzny ; W. C. Warren ; K. C. Worley ; J. Rogers ; R. K. Wilson ; R. A. Gibbs
Nature Publishing Group (NPG)
Published 2014

An early modern human from Romania with a recent Neanderthal ancestor

Q. Fu ; M. Hajdinjak ; O. T. Moldovan ; S. Constantin ; S. Mallick ; P. Skoglund ; N. Patterson ; N. Rohland ; I. Lazaridis ; B. Nickel ; B. Viola ; K. Prufer ; M. Meyer ; J. Kelso ; D. Reich ; S. Paabo
Nature Publishing Group (NPG)
Published 2015

Massive migration from the steppe was a source for Indo-European languages in Europe

W. Haak ; I. Lazaridis ; N. Patterson ; N. Rohland ; S. Mallick ; B. Llamas ; G. Brandt ; S. Nordenfelt ; E. Harney ; K. Stewardson ; Q. Fu ; A. Mittnik ; E. Banffy ; C. Economou ; M. Francken ; S. Friederich ; R. G. Pena ; F. Hallgren ; V. Khartanovich ; A. Khokhlov ; M. Kunst ; P. Kuznetsov ; H. Meller ; O. Mochalov ; V. Moiseyev ; N. Nicklisch ; S. L. Pichler ; R. Risch ; M. A. Rojo Guerra ; C. Roth ; A. Szecsenyi-Nagy ; J. Wahl ; M. Meyer ; J. Krause ; D. Brown ; D. Anthony ; A. Cooper ; K. W. Alt ; D. Reich
Nature Publishing Group (NPG)
Published 2015

The complete genome sequence of a Neanderthal from the Altai Mountains

K. Prufer ; F. Racimo ; N. Patterson ; F. Jay ; S. Sankararaman ; S. Sawyer ; A. Heinze ; G. Renaud ; P. H. Sudmant ; C. de Filippo ; H. Li ; S. Mallick ; M. Dannemann ; Q. Fu ; M. Kircher ; M. Kuhlwilm ; M. Lachmann ; M. Meyer ; M. Ongyerth ; M. Siebauer ; C. Theunert ; A. Tandon ; P. Moorjani ; J. Pickrell ; J. C. Mullikin ; S. H. Vohr ; R. E. Green ; I. Hellmann ; P. L. Johnson ; H. Blanche ; H. Cann ; J. O. Kitzman ; J. Shendure ; E. E. Eichler ; E. S. Lein ; T. E. Bakken ; L. V. Golovanova ; V. B. Doronichev ; M. V. Shunkov ; A. P. Derevianko ; B. Viola ; M. Slatkin ; D. Reich ; J. Kelso ; S. Paabo
Nature Publishing Group (NPG)
Published 2013

Great ape genetic diversity and population history

J. Prado-Martinez ; P. H. Sudmant ; J. M. Kidd ; H. Li ; J. L. Kelley ; B. Lorente-Galdos ; K. R. Veeramah ; A. E. Woerner ; T. D. O'Connor ; G. Santpere ; A. Cagan ; C. Theunert ; F. Casals ; H. Laayouni ; K. Munch ; A. Hobolth ; A. E. Halager ; M. Malig ; J. Hernandez-Rodriguez ; I. Hernando-Herraez ; K. Prufer ; M. Pybus ; L. Johnstone ; M. Lachmann ; C. Alkan ; D. Twigg ; N. Petit ; C. Baker ; F. Hormozdiari ; M. Fernandez-Callejo ; M. Dabad ; M. L. Wilson ; L. Stevison ; C. Camprubi ; T. Carvalho ; A. Ruiz-Herrera ; L. Vives ; M. Mele ; T. Abello ; I. Kondova ; R. E. Bontrop ; A. Pusey ; F. Lankester ; J. A. Kiyang ; R. A. Bergl ; E. Lonsdorf ; S. Myers ; M. Ventura ; P. Gagneux ; D. Comas ; H. Siegismund ; J. Blanc ; L. Agueda-Calpena ; M. Gut ; L. Fulton ; S. A. Tishkoff ; J. C. Mullikin ; R. K. Wilson ; I. G. Gut ; M. K. Gonder ; O. A. Ryder ; B. H. Hahn ; A. Navarro ; J. M. Akey ; J. Bertranpetit ; D. Reich ; T. Mailund ; M. H. Schierup ; C. Hvilsom ; A. M. Andres ; J. D. Wall ; C. D. Bustamante ; M. F. Hammer ; E. E. Eichler ; T. Marques-Bonet
Nature Publishing Group (NPG)
Published 2013

Genetic evidence for two founding populations of the Americas

P. Skoglund ; S. Mallick ; M. C. Bortolini ; N. Chennagiri ; T. Hunemeier ; M. L. Petzl-Erler ; F. M. Salzano ; N. Patterson ; D. Reich
Nature Publishing Group (NPG)
Published 2015

The genetic history of Ice Age Europe

Q. Fu ; C. Posth ; M. Hajdinjak ; M. Petr ; S. Mallick ; D. Fernandes ; A. Furtwangler ; W. Haak ; M. Meyer ; A. Mittnik ; B. Nickel ; A. Peltzer ; N. Rohland ; V. Slon ; S. Talamo ; I. Lazaridis ; M. Lipson ; I. Mathieson ; S. Schiffels ; P. Skoglund ; A. P. Derevianko ; N. Drozdov ; V. Slavinsky ; A. Tsybankov ; R. G. Cremonesi ; F. Mallegni ; B. Gely ; E. Vacca ; M. R. Morales ; L. G. Straus ; C. Neugebauer-Maresch ; M. Teschler-Nicola ; S. Constantin ; O. T. Moldovan ; S. Benazzi ; M. Peresani ; D. Coppola ; M. Lari ; S. Ricci ; A. Ronchitelli ; F. Valentin ; C. Thevenet ; K. Wehrberger ; D. Grigorescu ; H. Rougier ; I. Crevecoeur ; D. Flas ; P. Semal ; M. A. Mannino ; C. Cupillard ; H. Bocherens ; N. J. Conard ; K. Harvati ; V. Moiseyev ; D. G. Drucker ; J. Svoboda ; M. P. Richards ; D. Caramelli ; R. Pinhasi ; J. Kelso ; N. Patterson ; J. Krause ; S. Paabo ; D. Reich
Nature Publishing Group (NPG)
Published 2016

Genome-wide patterns of selection in 230 ancient Eurasians

I. Mathieson ; I. Lazaridis ; N. Rohland ; S. Mallick ; N. Patterson ; S. A. Roodenberg ; E. Harney ; K. Stewardson ; D. Fernandes ; M. Novak ; K. Sirak ; C. Gamba ; E. R. Jones ; B. Llamas ; S. Dryomov ; J. Pickrell ; J. L. Arsuaga ; J. M. de Castro ; E. Carbonell ; F. Gerritsen ; A. Khokhlov ; P. Kuznetsov ; M. Lozano ; H. Meller ; O. Mochalov ; V. Moiseyev ; M. A. Guerra ; J. Roodenberg ; J. M. Verges ; J. Krause ; A. Cooper ; K. W. Alt ; D. Brown ; D. Anthony ; C. Lalueza-Fox ; W. Haak ; R. Pinhasi ; D. Reich
Nature Publishing Group (NPG)
Published 2015

The landscape of recombination in African Americans

A. G. Hinch ; A. Tandon ; N. Patterson ; Y. Song ; N. Rohland ; C. D. Palmer ; G. K. Chen ; K. Wang ; S. G. Buxbaum ; E. L. Akylbekova ; M. C. Aldrich ; C. B. Ambrosone ; C. Amos ; E. V. Bandera ; S. I. Berndt ; L. Bernstein ; W. J. Blot ; C. H. Bock ; E. Boerwinkle ; Q. Cai ; N. Caporaso ; G. Casey ; L. A. Cupples ; S. L. Deming ; W. R. Diver ; J. Divers ; M. Fornage ; E. M. Gillanders ; J. Glessner ; C. C. Harris ; J. J. Hu ; S. A. Ingles ; W. Isaacs ; E. M. John ; W. H. Kao ; B. Keating ; R. A. Kittles ; L. N. Kolonel ; E. Larkin ; L. Le Marchand ; L. H. McNeill ; R. C. Millikan ; A. Murphy ; S. Musani ; C. Neslund-Dudas ; S. Nyante ; G. J. Papanicolaou ; M. F. Press ; B. M. Psaty ; A. P. Reiner ; S. S. Rich ; J. L. Rodriguez-Gil ; J. I. Rotter ; B. A. Rybicki ; A. G. Schwartz ; L. B. Signorello ; M. Spitz ; S. S. Strom ; M. J. Thun ; M. A. Tucker ; Z. Wang ; J. K. Wiencke ; J. S. Witte ; M. Wrensch ; X. Wu ; Y. Yamamura ; K. A. Zanetti ; W. Zheng ; R. G. Ziegler ; X. Zhu ; S. Redline ; J. N. Hirschhorn ; B. E. Henderson ; H. A. Taylor, Jr. ; A. L. Price ; H. Hakonarson ; S. J. Chanock ; C. A. Haiman ; J. G. Wilson ; D. Reich ; S. R. Myers
Nature Publishing Group (NPG)
Published 2011

C. elegans ADARs antagonize silencing of cellular dsRNAs by the antiviral RNAi pathway [Research Papers]

Reich, D. P., Tyc, K. M., Bass, B. L.
Cold Spring Harbor Laboratory Press
Published 2018

Arrival routes of first Americans uncertain

Potter, B. A., Beaudoin, A. B., Haynes, C. V., Holliday, V. T., Holmes, C. E., Ives, J. W., Kelly, R., Llamas, B., Malhi, R., Miller, S., Reich, D., Reuther, J. D., Schiffels, S., Surovell, T.
American Association for the Advancement of Science (AAAS)
Published 2018

Ancient genomes document multiple waves of migration in Southeast Asian prehistory

Lipson, M., Cheronet, O., Mallick, S., Rohland, N., Oxenham, M., Pietrusewsky, M., Pryce, T. O., Willis, A., Matsumura, H., Buckley, H., Domett, K., Nguyen, G. H., Trinh, H. H., Kyaw, A. A., Win, T. T., Pradier, B., Broomandkhoshbacht, N., Candilio, F., Changmai, P., Fernandes, D., Ferry, M., Gamarra, B., Harney, E., Kampuansai, J., Kutanan, W., Michel, M., Novak, M., Oppenheimer, J., Sirak, K., Stewardson, K., Zhang, Z., Flegontov, P., Pinhasi, R., Reich, D.
American Association for the Advancement of Science (AAAS)
Published 2018